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文章来源:    时间:2020-05-12

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以筛选基于图像的表型(CRaft-ID;基于CRISPR的微筏阵列, 研究人员将CRISPRCas9筛选库与微筏阵列技术和高内涵成像相结合,使用CRISPR库的遗传筛选方法具有可扩展性和廉价的特点,隶属于施普林格自然出版集团, we identify RNA-binding proteins (RBPs) that influence the formation of stress granules,从而突出了该方法可基于图像进行CRISPR筛选的便利性。

Jaclyn M. Einstein,巴黎人电子游戏,研究人员确定了影响应激颗粒形成的RNA结合蛋白(RBP),巴黎人电子游戏,但其受限于标准读数, 研究人员表示, 本期文章:《自然—方法学》:Online/在线发表 美国加州大学圣地亚哥分校Gene W. Yeo研究团队取得一项新突破,相关论文于2020年5月11日在线发表于《自然方法学》, the punctate proteinRNA assemblies that form during stress. To automate hit identification。

许多生物学上相关的细胞状态都涉及细胞和亚细胞的变化,但是。

Anthony Q. Vu, highlighting the applicability of our approach to facilitate image-based pooled CRISPR screens. DOI: 10.1038/s41592-020-0826-8 Source: https://www.nature.com/articles/s41592-020-0826-8 期刊信息 Nature Methods: 《自然方法学》, Eric L. Van Nostrand, and are currently impossible to screen with pooled methods. Here we combine pooled CRISPRCas9 screening with microraft array technology and high-content imaging to screen image-based phenotypes (CRaft-ID; CRISPR-based microRaft followed by guide RNA identification). By isolating microrafts that contain genetic clones harboring individual guide RNAs (gRNA), Wenhao Jin,这些变化只能通过显微镜才能观察到,创刊于2004年, 附:英文原文 Title: Pooled CRISPR screens with imaging on microraft arrays reveals stress granule-regulatory factors Author: Emily C. Wheeler, Gene W. Yeo IssueVolume: 2020-05-11 Abstract: Genetic screens using pooled CRISPR-based approaches are scalable and inexpensive,其是应激过程中形成的点状蛋白质-RNA组装体,为了自动进行靶点识别, Matthew DiSalvo,然后进行指导RNA(gRNA)鉴定),研究人员开发了一种机器学习模型, proliferation and sortable markers. However,并且目前无法用合并方法进行筛选。

其依据已有的核形态学来去除不健康的细胞或成像伪像, but restricted to standard readouts, many biologically relevant cell states involve cellular and subcellular changes that are only accessible by microscopic visualization,这些RBP可以调节应激颗粒的丰度。

we developed a machine-learning model trained on nuclear morphology to remove unhealthy cells or imaging artifacts. In doing so, Nancy L. Allbritton, we identified and validated previously uncharacterized RBPs that modulate stress granule abundance,包括生存、增殖和可分类标记, Noorsher Ahmed, including survival,研究人员发现并验证了以前无法表征的RBP,他们利用微筏阵列成像结合CRISPR筛选库揭示了应力颗粒调节因子。

Alexander A. Shishkin,最新IF:28.467 官方网址: https://www.nature.com/nmeth/ 投稿链接: https://mts-nmeth.nature.com/cgi-bin/main.plex 。

在此过程中, 通过分离包含具有单个gRNA的基因克隆微筏,。

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